АТОЛ Онлайн является облачным решением, и основная часть его инфраструктуры располагается в специальном центре обработки данных. Инфраструктура ЦОДа подразумевает многоуровневую охрану, качественное и стабильное питание оборудования от двух независимых фидеров, надежное оптоволоконное соединение с операторами связи, наличие систем кондиционирования и пожаротушения.
Но в силу специфики функционирования сервиса при его развертывании было решено добавить к стандартным возможностям, предоставляемым инфраструктурой ЦОДа, собственные решения, обеспечивающие как дополнительную безопасность, так и удобство работы.